Сергей Бабкин окончил Тюменское высшее
военное училище и Краснознаменный институт имени Ю.В.Андропова. Во время
событий в республике Дагестан являлся заместителем начальника УФСБ РФ по
Северо-Кавказскому военному округу. В ходе контртеррористической операции на
территории Чеченской республики возглавлял оперативную группу ФСБ РФ по
группировке "Запад", которой командовал Владимир Шаманов.
С 19 февраля 2001 года -
начальник УФСБ по Чеченской республике.